Beim Aktivieren eines CNC-Systems werden die gewünschten Schnitte in die Software programmiert und den entsprechenden Werkzeugen und Maschinen vorgegeben, die die maßlichen Aufgaben wie angegeben ausführen, ähnlich wie ein Roboter.
Bei der CNC-Programmierung geht der Codegenerator im numerischen System oft davon aus, dass die Mechanismen fehlerfrei sind, trotz der Möglichkeit von Fehlern, die größer ist, wenn eine CNC-Maschine angewiesen wird, in mehr als eine Richtung gleichzeitig zu schneiden. Die Platzierung eines Werkzeugs in einem numerischen Steuerungssystem wird durch eine Reihe von Eingaben beschrieben, die als Teileprogramm bezeichnet werden.
Bei einer CNC-Maschine werden die Programme über Lochkarten eingegeben. Im Gegensatz dazu werden die Programme für CNC-Maschinen über kleine Tastaturen in den Computer eingegeben. Die CNC-Programmierung wird im Speicher eines Computers gespeichert. Der Code selbst wird von Programmierern geschrieben und bearbeitet. Daher bieten CNC-Systeme eine weitaus größere Rechenkapazität. Und das Beste daran ist, dass CNC-Systeme keineswegs statisch sind, da durch überarbeiteten Code neuere Eingabeaufforderungen zu bereits vorhandenen Programmen hinzugefügt werden können.